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末梢血液幹細胞には血液を作る造血母細胞が多量存在しており、かなり以前から、白血病、リンパ腫、多発性骨髄腫などの血液癌の標準治療として使われてきた。
兔疫細胞は、その特性として、体にできる癌細胞を殺す役割をするため、多様な癌患者に兔疫細胞を利用した治療法が施行されているが、発病後は、健康な時と比べて兔疫細胞の機能が低下して治療効果が減少する。
脂肪幹細胞は主に美容成形のために使われているが、糖尿病、心筋梗塞、虚血性末梢血管疾患などの疾病治療についても盛んに研究が行なわれている。
臍帯血には血液を作る造血母細胞が多量存在しており、かなり以前から、白血病、再生不良性貧血などの血液疾患の標準治療法として使われている。
最近、脳性マヒ、尿失禁、脊髄損傷などの疾患でも臍帯血を利用した治療が始まっている。
間葉幹細胞が豊富な胎盤幹細胞はやけど、炎症性疾患、肝疾患、自家免疫疾患、神経系疾患治療に活用できることが期待されている。